鲤城区科学技术协会前身为晋江地区泉州市科学技术普及协会，成立于一九五六年二月，一九五八年十月改称泉州市科学技术协会（简称市科协），“文化大革命”中被撤销，一九八一年七月恢复市科协，一九八六年六月改称鲤城区科学技术协会（简称区科协），2006年区机构三定方案确定科协为正科级，现内设4个科（室）、1个下属单位，即办公室、普及部、学会部、院士专家服务站，下属单位为鲤城区青少年科技服务中心。

鲤城区科协是党领导下的人民团体，是党和政府联系科技工作者的桥梁和纽带。在中共鲤城区委、区人民政府的领导下，在福建省科协和泉州市科协的指导下，区科协充分发挥学术交流的主渠道、科学技术普及的主力军、国际民间科技交流的主要代表和科技工作者之家的独特作用，坚持“科学技术是第一生产力”，坚持科教兴国和可持续发展战略，坚持服从服务加快发展第一要务，各项工作取得长足进步，科协组织遍及江南高新技术园区和街道、社区，拥有11个市级学会（协会、研究会），成为覆盖自然科学、社会科学等多学科多层次的科协组织。